内异症的治疗要根据病人的年龄，症状的严重程度以及体征和生育要求决定。如果不育症同时合并附件包块，首选手术治疗，如果没有附件包块，首选药物治疗，包括放置曼月乐环。如果有生育要求，只能做一次手术，多次手术会加重盆腔黏连，更不利于怀孕。
子宫内膜异位症与高雌激素的环境有关。孕期、绝经后雌激素水平下降，异位灶就会萎缩。药物治疗的目的就是达到闭经的状态，使病灶萎缩。但是太大的病灶有可能不能完全萎缩，达不到自愈目的，如果是快绝经的女性，就不一定需要手术了。
子宫内膜异位症的发生原因与子宫内膜异位症发生的机制有关，首先一个是经血逆流，所以如果是经期就尽量避免同房以及剧烈活动，防止经血逆流。因为子宫内膜异位症是一个原因不是很明确的疾病。所以，只能做到定期检查，早期发现，早处理。
子宫内膜异位症，正常的子宫内膜是在子宫腔里，子宫腔里的内膜跑到了子宫的外面就叫子宫内膜异位症。子宫内膜异位症在临床上最常异位的是卵巢，有的时候还会有骶韧带在盆腔里；出了盆腔以后，是一个全身性的疾病；有的还会异位到其它的各个脏器器官。当然女性的内膜异位症来讲，受累最多的还是卵巢，所以在临床上，有可能会造成卵巢的子宫内膜异位症，最常见的症状主要是痛经，表现在痛经、月经的改变、不孕，包括有腰骶部的不适，症状会很多。主要是根据异位的不同部位，症状也会不一样。
正常的子宫内膜是长在子宫腔里，子宫腔的内膜跑到了子宫以外叫子宫内膜异位症。子宫内膜异位症，如果它异位在肌层，就叫子宫腺肌症，所以它是同一个病，异位的地方不一样而已。子宫腺肌症是子宫内膜异位症的一个特殊方式，只是异位到了子宫的肌层，就叫子宫腺肌症，在临床上来讲，子宫腺肌症的方法有很多，主要是根据子宫腺肌症对病人造成了什么样的症状，来决定它的后续治疗；有的时候会造成月经量的增多、痛经。还要根据病人有没有生育的愿望，有没有保留子宫的要求，来处理子宫腺肌症。
子宫内膜异位症的治疗，就像糖尿病一样，是一个慢性疾病，一直管理到绝经期，所以在女性的一生中，如果得了子宫内膜异位症，在临床上就要终身的随访，一直随访到病人的绝经年龄。它的治疗方式有很多，比如说早期如果是病人主要表现为痛经，卵巢的囊肿也不大，可以考虑药物治疗，包括中医的活血化瘀能缓解痛经也是可以的；如果囊肿持续存在，而且肿瘤标记物也升高，病人痛经越来越严重，可以考虑用腹腔镜的方式来治疗子宫内膜的异位症，既然是一个慢病，子宫内膜异位症术后一定要跟上治疗，包括术后的GnRH的治疗，包括术后的避孕药治疗，应用起来都是有手术指征，一直要管理到绝经期，这个病才会好，而且要长期的管理
足跟骨刺，足跟痛。