先天性食道闭锁的分类和类型，目前在国际上公认是五类，根据气管和食管、气管瘘和食管之间的关系，大体分为五类。最常见的是第Ⅲ型，Ⅲ型又细分成两型，比较多见的是ⅢB类，大概占全部先天性食管闭锁的95％左右，其它的类型相对比较少见；最少见的类型是Ⅰ型食道闭锁，发病率最低，治疗也最困难。
近几年医疗水平有很大的发展，尤其是在产前B超这方面进步非常明显。据了解，部分基层医院或者是中级的专业妇产医院，甚至更好的医院，都能够通过产前B超的技术，在产前24周，最迟在产前32周左右，能明确地诊断出先天性食道闭锁，而且准确率比较高。