慢性咳嗽临床当中常见的病因有很多，但是最常见的原因可以归纳为四大类。最常见的原因叫咳嗽变异性哮喘，是属于哮喘的一种特殊表现形式。它的临床表现并不是喘，而是这种阵发性的丛集性的咳嗽，尤其当患者出现夜间和凌晨，这种阵发性的咳嗽又和闻到刺激性的气味有相关性的时候，要高度怀疑咳嗽变异性哮喘的诊断。第二点就是叫上气道咳嗽综合征，这个疾病在很大程度上和以前所称的鼻后滴漏综合征是相互重叠的，当患者因为感冒或者是因为慢性鼻炎等，一些疾病导致了鼻腔，或者上呼吸道出现了有分泌物，分泌物沿着鼻咽部向后反流到咽部的时候就会刺激我们的嗓子，刺激我们喉咙，出现咽痒。这种剧烈的咽痒就会导致患者阵发性的咳嗽，而且日久不愈，出现这样一个情况。这是上气道咳嗽综合征，这样的一类疾病。第三大类疾病胃食管反流，也就是因为由于胃和食管所导致的胃内容物和胃内酸性物质的反流，这种反流的气体或者反流的胃内容物会刺激咽喉部，也会出现咽喉的阵发性的瘙痒，阵发性的不适这样也会出现咳嗽，尤其这种阵发性的咳嗽。这一类的患者除了以咽痒咳嗽为主之外，还有相当一部分患者可能会出现上腹部的不适感。比如腹胀、打嗝、反酸等，这样一些症状的时候，医生就要考虑到是否出现了胃食管反流所导致的咳嗽的可能性。第四点就是嗜酸粒细胞性支气管炎，这个疾病和咳嗽变异性哮喘有一定的近似性。它的特点就是嗜酸粒细胞在气道内的浓度会比较高，如果用检查痰的方法，痰里面是酸粒细胞的基数会大于5％，这个疾病它的临床表现和咳嗽变异性哮喘在症状上有很多的重叠性，唯一的区别就是咳嗽变异性哮喘。在做肺功能检查的时候，气道高反应性是阳性的，而嗜酸粒细胞性支气管炎它的气道高反应性是阴性的，再加上他的痰里面的嗜酸粒细胞增多，就可以诊断他为嗜酸粒细胞性支气管炎。它的治疗也和咳嗽变异性哮喘有一定接近的地方，所以有的学者认为这两个病是有一定重叠性的，而且它俩在临床上鉴别诊断，也的确存在一定的困难。所以说有的时候，也有的人主张把两个病合在一起。总而言之，慢性咳嗽最常见的原因就是以上四种。当然还会有其他一些少见的原因也会引起慢性咳嗽，需要在临床当中仔细的鉴别。
慢性咳嗽用什么药：
机体各个系统的多种疾病均可引起咳嗽，临床上引起咳嗽的疾病多达数百种之多。慢性咳则多见于慢性支气管炎、支气管扩张、支气管肺癌、肺结核、肺间质性病、吸入性肺炎、咽喉部疾病等。根据文献慢性咳嗽定义为:
1、咳嗽至少3周；
2、咳嗽是现有的惟一症状；
3、不伴咯血
4、否认咳嗽相关的慢性呼吸系统疾病；
5、近期胸部Ⅹ线检查难以确诊；
6、有痰或无痰。慢性咳嗽的治疗主要是针对病因治疗。
有的慢性咳嗽由吸烟引起，胸部X线排除了肺部其他疾病，可建议患者戒烟，同时予以祛痰药口服治疗。有的慢性咳嗽由一些特殊病原体导致，若结核、真菌等，可分别予以抗结核药、抗真菌药治疗。各年龄段不吸烟的慢性咳嗽患者，最常见的原因是鼻后滴流综合征，哮喘和食管反流性疾病。鼻后滴流综合征治疗上可口服抗过敏药 （抗组胺药）西替利秦、开瑞坦或氯雷他定，鼻腔内可滴用伯克纳、辅舒良或者内舒拿鼻喷雾。食管反流性疾病可给予抑酸、胃肠动力药治疗。
慢性咳嗽不等于慢性气管炎，因为慢性咳嗽只是一个症状。很多疾病都有慢性咳嗽，而慢性气管炎是一组疾病的名称。除慢性气管炎以外，很多呼吸道疾病，包括支气管扩张、肺结核、肺间质纤维化，甚至很多过敏性气道疾病都会导致慢性咳嗽。所以，慢性咳嗽绝对不能等同于慢性气管炎。有的病人到医院就诊，医生不够专业的时候，认为慢性咳嗽就可以跟慢性气管炎划等号。实际是完全不一样的，有很多导致慢性咳嗽的疾病都跟慢性气管炎没有关系。