引起肾结石的原因包括基因遗传和一些先天性疾病，如肾脏功能发育不全等。若患有皮质醇增多症或糖尿病等机体代谢异常类疾病，也可逐渐诱发肾结石出现。而在临床方面多见的原发病还有尿路梗阻及各种泌尿系统感染疾病。另外，还可能是不良饮食结构所致。
肾结石在近几年发病几率似乎一直有上升趋势，而且患者年龄也逐渐趋于年轻化。如果平时出现有肾绞痛等难以忍受的疼痛感，且伴随有血尿和尿痛等症状，就可能是肾结石所致，此时就要明确病因再接受治疗。那么是什么原因引起的肾结石呢？
1、先天性遗传
肾结石发病与基因遗传等先天性因素有关联。如果有家族发病史，则个人患上肾结石可能性就会明显增加。对于患有肾脏功能发育不全等一类先天性发育异常疾病的患者来说，也比较容易让尿液中结晶物体浓度升高，从而形成肾结石。
2、机体代谢异常
机体代谢异常是肾结石常见诱发因素。一旦机体新陈代谢能力发生异常，特别是患有皮质醇增多症、糖尿病和甲状旁腺功能亢进症等疾病的人群，就会容易导致尿液析出晶体，并在肾脏部位生长集聚，最终可形成结石。另外，嘌呤代谢异常时可形成高尿酸血症，若得不到治疗也可发展为肾结石。
3、泌尿系统疾病
泌尿系统疾病可导致肾结石等泌尿系结石疾病的发病几率大大提高。其中比较多见的有尿道畸形和尿路梗阻，可导致尿液浓缩和结晶沉淀。若患有尿路感染或尿道炎等泌尿系统感染性疾病，可引起细胞脱落，促使磷酸盐发生沉淀，沉淀物增多的情况下就会形成结石。
4、不良饮食结构
若在平时喜欢进食草酸、脂肪以及蛋白质含量高的食物，比如菠菜、动物内脏等，就可能会让肾脏和尿液当中的尿酸和草酸一类成分增高。此时若肾脏不能将多余物质排出体外，就可能会导致结石在肾脏当中形成。同时饮食不规律和暴饮暴食都可成为肾结石诱因。
肾结石的原因：
肾结石是泌尿系结石当中的一种类型，是指结石位于肾盂之内或者肾盏部位。肾结石的成因目前不是非常清楚，多种因素会导致，包括饮食、饮水、所居住的地区的气候特点，也可能与人种有关系，但多数情况下还是与人体本身体内的新陈代谢相关。
容易得肾结石的病人往往本身泌尿系统，尿液的代谢存在问题。容易得肾结石的病人尿液里面的晶体浓度很高，处于过饱和的状态，一旦发生各种各样的诱因，晶体就容易从尿液里面沉淀出来，然后由小变大，慢慢的变成一个结石，形成肾结石。
肾结石的病人，医生要根据肾结石状况选择是否进行经皮肾镜碎石。如果石头较小或单发，位置比较好，一般会选择做体外碎石。如果体外碎石时发现石头很大，或多发，体外碎石的次数很多，对肾脏损伤太大。这时医生会建议患者做进一步治疗，进一步治疗创伤更小一些。例如输尿管的硬镜，或输尿管软镜碎石。如果这种方法处理不干净，或肾结石很多，或其他因素导致无法做，可以选择做体外经皮肾镜碎石。所以这是一个选择的逐步过程，先选择体外碎石，效果差时可以做输尿管的软镜或硬镜碎石，最后再选择经皮肾镜碎石。
结石的形成与很多因素有关。比如性别、年龄、环境、饮食等。主要表现为身体代谢的异常，尿路的梗阻、感染，某些药物作用，这些是常见引起肾结石的因素。代谢因素需要特别提出，代谢综合征与肾结石的形成有密切的关系，高尿酸血症容易形成肾结石。
肾结石是肾里的结石，是指发生于肾盏、肾盂及肾盂与输尿管连接部的结石。多数位于肾盂肾盏内，肾实质结石少见。肾是泌尿系统的一部分。泌尿系统分为、肾、输尿管、膀胱、尿道等。结石就长靠近泌尿系统最上部分、从尿里面分解、分离出来。就像海水通过太阳晒以后，出现了一个盐的道理。结石也是尿里溶质吸出来以后，变成颗粒逐步增形成的肾结石。平片显示肾区有单个或多个圆形、卵圆形或钝三角形致密影，密度高而均匀。边缘多光滑，但也有不光滑呈桑椹状。肾是泌尿系形成结石的主要部位。
任何一种手术都存在风险，横向比较结石的手术，要比肿瘤的手术风险要低，创伤要小，干扰要小，结石手术的输血率大概就只有1%，当然手术技术不行，那病人的并发症就会随之而增加，所以要选择知名的专家，选择更大的医院来治疗。