卵巢囊肿本身，跟内分泌功能有一定的关系。常规的治疗，包括生殖中心的促排卵治疗，有的时候需要补充雌激素。如果有卵巢囊肿需要补充其雌激素，最好是到医院由医生明确诊断以后，证明需要补充雌激素的利大于弊，然后再进行补充。除了激素治疗还有其他治疗方法，患者要根据病情选择及时治疗。
卵巢囊肿一般可以分为良性和恶性两种，一般来说囊肿大小在正常范围就是一个良性的囊肿，良性囊肿通常在1—3厘米，这个时候应该观察三个月，如果经过两个月左右的时间卵巢囊肿缩小或没有增加，在一段时间内囊肿后会自行消失，这种情况不用进行手术。那么，卵巢囊肿能不能补雌激素？
卵巢囊肿又称巧克力囊肿，是因为在手术中所见像巧克力而得名，雌激素会诱发出血，如果你还未婚或者没有生育，现在不主张手术，因为手术会引起进一步的粘连而影响排卵，至于小剂量的雌激素不会有多大的风险。不过在选择服用雌激素时一定要经过医生建议，避免误食。
卵巢囊肿治疗
1、保守手术
包括剖腹手术和腹腔镜手术，将盆腔粘连进行分离，电灼或切除盆腔病灶，卵巢内膜异位囊肿剥出术，子宫悬吊术，与子宫肌瘤同时发生时要一现切除，当有严重的痛经患者，可以同时做骶前神经切除。
2、半保守手术
主要目的是切除子宫和子宫内膜异位症，保留卵巢功能。它适用于45岁以下，无生育要求，或有广泛的病灶，不能保留生育功能，或与子宫肌瘤或子宫腺肌症结合。
3、根治手术
全子宫切除术和双侧附件切除术，不保留卵巢功能。如果病情严重不能进行全子宫切除术，可能会有子宫切除术或只有双侧卵巢。只适用于接近绝经期，或虽然年轻但疾病严重者。
卵巢囊肿在1~3公分之间是正常的，定期观察即可。如果超过4cm就可及时进行医治，避免疾病恶化。可以选择手术治疗，有保守手术、半保守手术以及根治手术等等。同时要注意术后做好护理工作。
生理性卵巢囊肿会疼吗：
一般来讲，卵巢囊肿位于盆腔，卵巢表面没有痛觉的神经小体，所以它不会造成疼痛，当它破裂，破裂以后囊内液刺激腹腔，在腹腔的腹膜的表面会有很多的神经纤维，它会感觉疼痛，但是这种疼痛时间会很短暂。可能也就半天的时间，或者一天的时间，常常发生在月经的中间期，也就是排卵日。但是绝大部分人是没有这种感觉的，有些比较敏感的女性，她可能这个月左下腹会疼那么半天。
下个月右下腹会疼那么半天，这时候她自己都能判断，这是她的排卵日，另外，卵巢的生理性囊肿，如果说个别情况下长得比较大，它会发生扭转，扭转的时候会出现疼痛，但是这种概率非常非常的低，一般来讲，卵巢的生理性囊肿是不会有疼痛的感觉的。
卵巢囊肿影响怀孕吗：
卵巢囊肿分生理性和病理性。生理性的卵巢囊肿有时会随着孕期增大。当大于五公分的时候，可能会引起蒂扭转。病理性的卵巢囊肿则主要是巧克力囊肿，这种患者往往会引起机体内环境改变，会引起不孕或者是先兆流产或者是胎停的可能，所以对受孕有一定的影响。
建议患有巧克力囊肿的女性进行手术切除囊肿后再备孕，这样对怀孕的影响就不会很大，并且患者也不会因为囊肿的增长对胎儿造成影响。所以患者一旦发现卵巢囊肿，建议及时就医，让医生给出合适的方案。
卵巢囊肿术后的复发情况主要看其类型，若为恶性或交界性囊肿，均有复发的可能性；而在良性囊肿中，浆液性、黏液性囊肿和畸胎瘤的复发率较低，有少数会复发；对于巧克力囊肿，术后三年较多会复发，所以希望患者早结婚早怀孕。
如何判断卵巢囊肿是良性还是恶性：
在临床上，如果想要判断卵巢囊肿是良性还是恶性，最主要的诊断方法就是把囊肿拨下来送病理，去做化验。病理切片的诊断治疗和一部分的辅助检查，也是卵巢囊肿良恶性主要的判断方法。
对于大多数女性的卵巢囊肿，相对来说，良性卵巢囊肿的几率还是比恶性卵巢囊肿的几率要大得多。在临床上，如果一兜水样的囊肿里边，也就是超声提示没有回声，一般患者出现这种情况的时候，良性囊肿的可能性就会变得更大；恶性囊肿的提示一般是囊实性，也就是里边有实性成分，有特殊的血流信号，尤其是低阻的血流信号。如果患者出现这种情况，那在手术中，可能会送冰冻。但是石蜡切片才是最终判断卵巢囊肿是良性还是恶性的可靠方法。
卵巢囊肿破裂怎么办：
当卵巢囊肿长到一定的程度之后，在一部分外力的作用下，囊皮可能就会发生破裂的情况。
一旦卵巢囊肿发生破裂，患者就必须要及时到医院就诊。卵巢囊肿的并发症包括卵巢囊肿破裂、蒂扭转。在患者的囊肿破裂之后，如果囊肿破到没有血管的地方，可能症状不会太重；但是如果囊肿破裂到血管上，那就有可能会造成腹腔的内出血，这时候就需要急诊进行处理。在有些时候，女性朋友如果患上卵巢囊肿，有一部分患者还可能会出现畸胎瘤。如果患者因为某些原因，畸胎瘤的囊肿发生破裂，那里面的油脂以及毛发，都有可能会引起腹膜炎和腹痛的症状。因此，患者一定要重视起来，一旦卵巢囊肿发生破裂，就一定要及时到正规的医疗单位治疗，及时处理病情。