虽然丙肝病毒和艾滋病病毒都是通过血液、性途径或者垂直传播，但这两个病毒不是必然联系在一起的，流行病学检查容易把这两个病毒联系起来是因为它们有相同的传播途径，但是并不是说有了丙肝就一定有艾滋，或者有了艾滋就一定有丙肝，这个说法是不对的。艾滋病感染的人群可能容易合并感染丙肝病毒，叫共同感染，主要原因是这两个病毒的传播途径一样，而且在性途径和血液途径传播的时候，这两个病毒往往在一个个体内出现，这种情况比较多见，但并是说这两个病毒必须在一起，在治疗上也是这样，对于艾滋病的感染者要筛查他有没有丙肝病毒，对于丙肝病毒感染者也要筛查他有没有同时合并艾滋病病毒的感染，如果这两个病毒是联合到一起感染，在治疗上要根据患者的具体情况进行抗病毒治疗，目前两个病毒重叠感染常规是先治疗丙肝病毒，短期内把丙肝病毒消灭掉之后再针对HIV病毒进行治疗。
丙肝的传播途径：
丙肝的传播途径，第一个途径也是最多见的途径就是输血、献血方面的途径，比如像过去比较多见的混用血浆，叫做单采血，很早以前的一种献血的方式。血浆采完之后，所有的献血员为同一个血型，把他们的红细胞提取出来，然后把血浆混在一起再回输，这种传播的机会非常高。
另外手术器械消毒不彻底，有可能会感染。其它的像针灸，如果不是一次性的针灸器具，传染丙肝的机会也很高，其它像修脚也有可能。其它的途径像日常生活接触，很少会传播丙肝，夫妻之间也有可能，但是传播的机会都比较少。
丙肝病毒感染以后形成慢性感染或慢性肝炎，目前已经可以治愈，十年前用干扰素经过一年的治疗，治愈率能达到70%左右，十年后的今天已经可以避免干扰素治疗的不良反应，换用简单的口服药治疗。一般根据丙肝病毒具体的基因分型来给患者选择合理的药物治疗，如果没有肝硬化，仅仅是慢性丙型肝炎，一般情况下三个月就可以把慢性丙型肝炎治愈，如果患者感染丙肝病毒以后发展成肝硬化，这时治疗疗程要适当的延长，一般延长到六个月，95%左右的丙肝病毒可以彻底清除，从而有效避免患者将来发展成肝硬化或者肝癌的不良结局。
丙型肝炎是由丙肝病毒引起的一种传染性肝病，由病毒引起。病毒可以在人和人之间进行传播。丙型肝炎的传播途径和乙肝、艾滋病都非常相似，是通过血液和体液传播，而通过血液传播是丙肝的一个最常见的传播方式。除此以外，丙肝也可以通过体液传播。体液传播，最常见的一种传播模式就是性传播。同时丙肝也可以通过母婴传播。在所有的传播途径中，医源性传染，通过输血、做手术传染最为多见。因为丙肝病毒在人体内血液中的浓度或者含量比较低，它通过性传播和母婴传播的可能性还比较小。
丙型肝炎和乙型肝炎，只是从自然史的方面来评估哪个更严重，应该是丙型肝炎更严重。丙型肝炎发病非常隐匿。乙肝可以在早期表现出肝炎的症状，会出现浑身没有力气、吃不下饭、出现黄疸等。而丙肝在早期没有任何表现，只有发展到肝硬化和肝癌之后，才会表现出肝硬化和肝癌的很多症状，这个时候，肝脏已经被严重损害。从治疗角度上来讲，根治丙肝的药物只需要吃三个月，每天吃一片药就能把丙肝治好。而乙肝至今为止还不能够通过短期的治疗就得到根治。从这个角度来讲，丙型肝炎比乙型肝炎更容易治愈。
丙型肝炎的治疗现阶段只需要口服药物三个月就可痊愈。一般来说，对于明确诊断丙型肝炎的患者，首先进行基因型检测，对不同的基因型选择不同的药物。在吃药两个星期左右，进行丙肝病毒定量检查，评估疗效。在治疗三个月停药时再进行一次监测，可以明确病人是否治愈。在停药后的第三个月，给病人进行再次的病毒定量检测，如果病毒定量依然保持阴性状态，病就达到了根治，将来也不会复发。但是对于已经进展到肝硬化的丙型肝炎病人，虽然经过三个月治疗，能够让丙肝病毒彻底被清除，但肝硬化不可逆转，需要长期随访。