临床上确诊任何一种疾病都要根据病史、查体和辅助检查，首先要知道孩子是否存在发热、流涕、咳嗽、呕吐、腹泻感染病史，其次看孩子是否出现头疼、呕吐、抽搐、惊厥、意识障碍这些症状，之后查体要看孩子的颈抵抗是否存在、有无嘴角歪斜、双侧瞳孔是否等大、肌张力是否有改变、感觉是否存在异常，在此基础上完善腰椎穿刺检查，脑积液是确诊脑炎的金标准，腰穿之前要明确孩子是否有明显的颅高压、后颅窝占位性病变、皮肤穿刺部位有无感染，孩子的病情是否衰竭、休克状态，如果出现上述症状不能进行腰穿。后颅窝占位性病变也是腰穿的禁忌症，所以在腰穿之前一定要完善头颅核磁或者ct检查，除外后颅窝占位性病变，完善眼底检查，除外严重的颅内高压症状。
小儿脑膜炎是软脑膜弥漫性炎症性改变，由病毒、真菌、细菌、支原体、衣原体、肿瘤和结核杆菌等各种生物性致病因子侵犯软脑膜和脊髓膜引起。引起小儿脑膜炎的原因很多，首先，新生儿脑膜炎可以发生在宫内、产时和产后；其次，蚊虫叮咬、猫抓、血流感染邻近组织、颅腔与外界的通路受到致病微生物感染时，也会发生脑膜炎；孕母在感染细菌或病毒时、胎膜早破时也会引起脑膜炎的发生；此外小儿在接种、中耳炎、肺炎、败血症的时候也会引起脑膜炎的发生。
大多数小儿脑膜炎是轻症脑膜炎，预后较好。若小儿在脑膜炎发病初期或急性期出现长期反复抽搐、意识障碍，提示患儿预后较差，可能会出现神经系统后遗症。常见的后遗症症状有以下几种：反复抽搐、惊厥、耳聋、肢体运动障碍、肌张力改变、语言发育延迟、神经精神发育迟缓、脑积水、运动障碍等。小儿神经系统后遗症常出现在年幼的脑膜炎患者中，由于临床症状不典型，容易延误治疗或误诊，所以预后较差。因此小儿患脑膜炎时应尽早明确致病原因，采取有效治疗手段。
癫痫是小儿神经系统常见的疾病，是一种慢性反复发作性疾病，由多种原因引起的脑功能障碍的表现。临床上癫痫可以分为症状性癫痫、隐源性癫痫和特发性癫痫三种类型。其中症状性癫痫较为常见，主要病因为脑发育异常、脑积水、颅内出血、颅内感染等。患有脑膜炎的小儿，若病变损伤脑部神经元，造成其异常放电，引起患儿出现反复惊厥、意识障碍、行为异常时，考虑脑炎患儿有可能合并癫痫，应该完善脑电图检查协助诊断，明确损伤部位，积极治疗。
小儿脑膜炎分为传染性脑膜炎和非传染性脑膜炎。对于具有传染性的脑膜炎患儿，要进行隔离护理。小儿脑膜炎以发热、呕吐、惊厥、意识障碍为主要临床表现。在护理脑膜炎患儿时，若持续发热，要及时进行药物或物理降温；惊厥时要及时镇静止惊，同时垫舌垫防止患儿在惊厥时咬伤舌部；此外观察患儿是否存在意识障碍，若意识障碍时间较短，则可以进食水，同时进行静脉营养支持治疗，对于意识障碍时间比较长的患儿，要注意勤翻身、扣背，防止褥疮和坠积性肺炎的发生。