如何治疗巧克力囊肿：
巧克力囊肿的治疗，可以采用药物或者手术的方法治疗，迄今为止，除根治性的手术外，还没有一种理想的根治方法，无论是药物治疗或者是保守性的手术治疗，都有相当高的复发率。因此应该根据患者年龄、症状、体征、病变范围以及对生育要求，患者的主观愿望等因素加以选择。
强调个体化治疗，主张选对药物积极治疗，并结合密切随访复查，注意卵巢囊肿的性质变化，症状轻或者无症状的轻微病变患者选用期待疗法。
有生育要求的轻度患者明确诊断以后先行药物治疗，病情重者行保留生育功能的手术。
年轻但无生育要求的重症患者，可行保留卵巢功能手术，并辅以药物的治疗，症状及病变均严重的无生育要求的患者可以进行根治性手术。
手术方法有开腹手术和腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是本病最佳的处理方法，目前认为以腹腔镜确诊加手术以及药物为内异症治疗的金标准。
什么是巧克力囊肿：
巧克力囊就是囊肿里边的液体像巧克力的颜色，一般的都发生在卵巢，卵巢每个月在卵泡排卵时形成的黄体在排卵过程中会有些出血，时间长了以后颜色会变成巧克力色。还有一种情况就是子宫内膜异位囊肿，子宫内膜长在了卵巢上并伴随着月经的出血而出血，卵巢的出血排不出去就在局部形成囊肿，鲜血在肚子里边呆的时间长了以后，会变成巧克力颜色，所以俗称巧克力囊肿。
但是巧克力囊肿并不是完全由子宫内膜异位症造成的，比如说卵巢的浆液性或者黏性囊肿伴随着囊内的出血，时间长了以后也会成为咖啡色，也就变成了巧克力囊肿。总之巧克力囊肿绝大部分是子宫内膜异位囊肿，但是也有一少部分是其他的卵巢囊肿造成的。
巧克力囊肿是什么：
巧克力囊肿是长在卵巢上的囊肿，囊内的液体不是清亮的而是巧克力色的。因为这个囊肿内有出血，鲜血时间长了以后，就会变成巧克力色，所以俗称巧克力囊肿。一般来讲巧克力囊肿常见原因是子宫内膜异位症，但是也有少部分是因为卵巢的其他囊肿伴随着囊内出血变成了巧克力囊肿。
应该强调的是巧克力囊肿只是描述了囊肿内的囊液是巧克力的颜色，但并不能完全代表是卵巢的子宫内膜异位症。它可能是一个卵巢的囊肿合并囊内出血，也可能是一个恶性的肿瘤。卵巢的巧克力囊肿可以通过超声发现，但是超声只是看到卵巢有一个囊肿，囊内的回声不均匀，但是真正的巧克力囊肿的咖啡色，是要通过把囊液抽出来以后才能知道它是巧克力囊肿。
巧克力囊肿是什么病：
巧克力囊肿是囊肿长在了卵巢上，所以叫卵巢的巧克力囊肿。巧克力囊肿常常提示这个囊肿内的液体是陈旧性的出血造成的，导致巧克力囊肿的囊内出血，最常见的是卵巢的子宫内膜异位症。子宫内膜长在了卵巢上，它会随着月经出血而出血，日积月累就形成了巧克力囊肿。这个囊肿随着每次月经的出血而长大，长到一定程度以后可能会出现破裂。
还有一些囊肿，比如说卵巢的浆液性或黏性囊肿，也有可能会有囊内的出血，那么它的颜色也可能是巧克力色。但是在这个时候一定要把囊壁剥离下来在显微镜下去看，才能知道它到底是什么病，可能是子宫内膜异位症，也可能是一个卵巢的病理性的肿瘤。
巧克力囊肿是怎么造成的：
巧克力囊肿的形成原因一般有两个，一个原因是子宫内膜异位到了卵巢上，每个月子宫内膜出血，异位的子宫内膜也出血，日积月累这些出血不能排出体外，在局部聚积然后形成了囊肿，鲜血时间长了以后，就会变成巧克力色。
囊肿内的液体可能比较稀薄，也可能比较浓稠，但总的来讲它的成分是血液合并了一些液体。有些卵巢的浆液性肿瘤或者黏性肿瘤，它的囊内壁合并了出去，污染了囊内的液体，时间长了以后也会成为巧克力色。那么如何去鉴别巧克力囊肿是什么原因造成的，就需要把囊肿或者是囊壁剥离出来，在显微镜下去看，才能知道到底是巧克力囊肿、子宫内膜异位症还是其他的卵巢的肿瘤。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症，由于子宫内膜异位症的病灶移植到卵巢上，形成类似巧克力状的囊肿，所以叫巧克力囊肿。一旦确诊，建议做腔镜手术，是比较理想的治疗方法。还可以采取剥除术和一侧卵巢切除术，剥除术没有损伤，一侧卵巢切除术损伤一侧卵巢功能。