治疗甲沟炎首先需要应用消炎药来预防或者控制感染，除了口服药物以外，还需要配合外用药物进行消毒。甲沟炎较轻者，需要坚持每天碘伏消毒。甲沟炎已经出现化脓者，需要坚持每天用双氧水盐水冲洗，然后碘伏浸泡，有利于甲沟炎的恢复。
甲沟炎如何根治：
甲沟炎这个病在临床上比较多见，它的发生主要是由于比如指甲周围的微小的创伤，从而导致局部的细菌感染，在患处可以出现红、肿、热、痛等炎症反应，严重的可以出现化脓反应。
甲沟炎的治疗，对于急性的甲沟炎的治疗，取决于炎症影响的范围和脓肿是否形成；对于比较轻微的炎症反应，可以用碘伏等反复的擦拭，或者是用双氧水反复的冲洗；对于比较重的甲沟炎，则往往需要外用和口服一些抗生素类的药物。但是沟炎是比较容易复发的。
复发的原因，多数患者可能是由于指甲喜欢往肉里面钻。那么这个情况如果需要根治，那么临床上多数采用手术治疗的办法，通过手术的方式切除两侧多余的甲床，指甲不往肉里长了自然甲沟炎复发的几率就非常小了，目前是作为比较根治的一种治疗办法。
甲沟炎肉芽的发生主要是由于局部感染的刺激。肉芽肿较轻时，通过后期的抗感染治疗，大部分的肉芽肿可以去除。要每天坚持碘伏消毒，穿宽松鞋，以减少对局部刺激。避免穿高跟鞋。但是严重的肉芽肿，则需要进行甲沟炎根治手术，去除病因。